Specjalizacją Bonifraterskiego Centrum Medycznego są usługi medyczne świadczone zarówno w ramach Narodowego Funduszu Zdrowia jak i komercyjnie. Pacjenci mogą skorzystać z porad specjalistów takich jak diabetolog, kardiolog, laryngolog czy endokrynolog. Bonifraterskie Centrum Medyczne oferuje także leczenie szpitalne, prowadzi hospicja i dom seniora w Warszawie.